Всего три строчки и проблема с авто-обновлением плагинов и самого wordpress, которые расположены на byethost и проблема решена.
В wp-config добавить следующее:
if(is_admin()) { add_filter('filesystem_method', create_function('$a', 'return "direct";')); define('FS_CHMOD_DIR', 0755); }
